Les textes les plus fondamentaux sont marqués d'une astérisque. Il faut lire au moins l'un d'entre eux.
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Ouvrages de portée générale
*Descartes, Le discours de la méthode, 1637
Henri Poincaré, La science et l'hypothèse, 1902, Flammarion, Champs sciences, 2009.
*Thomas Kuhn, La structure des révolutions scientifiques, 1962 et 1970, Champs sciences, 2008.
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Les étapes de la constitution des sciences physiques
Galilée, Dialogue sur les deux grands systèmes du monde, 1632, Points sciences, 2000.
*Koyré, Du monde clos à l'univers infini, 1957, Gallimard, tel, 1988.
*Françoise Balibar, Galilée, Newton lus par Einstein : Espace et relativité, PUF, Coll. Philosophies, 2007.
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Les étapes de la constitution des sciences biologiques
Darwin, L'origine des espèces, 1859, Seuil, 2013 (traduction du texte original de la 1ère édition) ; GF, 1992.
Claude Bernard, Introduction à l'étude de la médecine expérimentale, 1865, Champs Flammarion, 2008.
Jean Rostand, Esquisse d'une histoire de la biologie, 1945, Paris, Éditions Gallimard, 1978.
Jacques Monod, Le hasard et la nécessité, 1970, Points essais, 1973.
*François Jacob, La logique du vivant, 1970, Gallimard, tel, 1976.
*Stephen Jay Gould, Le pouce du panda, 1980, tr. fr. Jacques Chabert, rééd. Paris, Grasset, Le Livre de Poche, 1996.
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Les étapes de la constitution des sciences de l'homme
*Durkheim, Les règles de la méthode sociologique, 1895, Flammarion, Champs classiques, 2010.
Henri-Irénée Marrou, De la connaissance historique, Paris, Le Seuil, 1954, Points Histoire, 1975 (6e édition).
Jean-Pierre Delas et Bruno Milly, Histoire des pensées sociologiques, Armand Colin, 2009.
Jean-François Braunstein et Évelyne Pewzner, Histoire de la psychologie, Armand Colin, 3e édition, 2010.